Будешь иметь большие неприятности; погибнешь.
По древним поверьям, душа умершего человека не сможет успокоиться и будет кружить над непогребенными костями до тех пор, пока их не соберут и не захоронят.
Если от человека после гибели мало что осталось, то захоронению подвергался даже прах. Для близких родственников мертвеца невозможность похоронить родного человека была страшной трагедией, да и сейчас это вряд ли изменилось.
В наши дни выражение «костей не соберёшь» означает, что ситуация создалась настолько опасная, что выйти из неё живым практически невозможно, непременно погибнешь.
Данный фразеологизм означает, как правило, угрозу или предупреждение о серьёзной опасности, которая может последовать за теми или иными действиями того человека, к которому обращаются с подобными словами.
А сам Фёдор Иванович? а два пистолета, висящие на стене? а две собаки, заплаченные сто рублей каждая?.. Сунься только — костей не соберёшь!
Дмитрий Васильевич Григорович. «Переселенцы»